1. Российским или иностранным заявителям может быть отказано в разрешении на проведение морских научных исследований, если морские научные исследования: создают или могут создать угрозу обороне и безопасности Российской Федерации; направлены на использование природных ресурсов внутренних морских вод и территориального моря; несовместимы с требованиями защиты окружающей среды, в том числе живых или неживых ресурсов; включают буровые работы на морском дне внутренних морских вод и территориального моря, использование взрывчатых веществ, пневмоустройств или привнесение загрязняющих веществ в морскую среду; включают создание, эксплуатацию или использование искусственных островов, установок и сооружений; создают помехи деятельности, проводимой Российской Федерацией во внутренних морских водах и в территориальном море.
2. Российскому или иностранному заявителю может быть отказано в разрешении на проведение морских научных исследований, если он имеет не выполненные перед Российской Федерацией обязательства, вытекающие из ранее проведенных морских научных исследований, а также если информация российского или иностранного заявителя, представленная в запросе, является неточной.